Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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