Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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Ttc9bQ9D6E4 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Ttc9bQ9D6E4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Ttc9bQ9D6E4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Ttc9bQ9D6E4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Ttc9bQ9D6E4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ttc9bQ9D6E4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ttc9bQ9D6E4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ttc9bQ9D6E4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ttc9bQ9D6E4 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ttc9bQ9D6E4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Ttc9bQ9D6E4 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Ttc9bQ9D6E4 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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