Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Odf2lQ9D478 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms