Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spns3Q9D232 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms