Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Syf2Q9D198 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Syf2Q9D198 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Syf2Q9D198 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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Syf2Q9D198 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Syf2Q9D198 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms