Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ccdc47Q9D024 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ccdc47Q9D024 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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