Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms