Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snf8Q9CZ28 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snf8Q9CZ28 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snf8Q9CZ28 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snf8Q9CZ28 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snf8Q9CZ28 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snf8Q9CZ28 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Snf8Q9CZ28 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snf8Q9CZ28 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Snf8Q9CZ28 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snf8Q9CZ28 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Snf8Q9CZ28 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snf8Q9CZ28 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snf8Q9CZ28 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snf8Q9CZ28 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snf8Q9CZ28 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snf8Q9CZ28 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snf8Q9CZ28 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Snf8Q9CZ28 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snf8Q9CZ28 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snf8Q9CZ28 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snf8Q9CZ28 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snf8Q9CZ28 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snf8Q9CZ28 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snf8Q9CZ28 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snf8Q9CZ28 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Snf8Q9CZ28 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snf8Q9CZ28 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snf8Q9CZ28 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snf8Q9CZ28 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snf8Q9CZ28 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snf8Q9CZ28 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snf8Q9CZ28 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snf8Q9CZ28 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms