Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms