Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms