Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms