Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms