Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms