Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms