Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms