Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms