Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Nicn1Q9CQM0 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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