Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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