Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms