Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sike1Q9CPR7 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sike1Q9CPR7 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sike1Q9CPR7 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sike1Q9CPR7 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sike1Q9CPR7 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sike1Q9CPR7 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sike1Q9CPR7 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sike1Q9CPR7 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sike1Q9CPR7 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sike1Q9CPR7 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sike1Q9CPR7 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sike1Q9CPR7 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sike1Q9CPR7 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sike1Q9CPR7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sike1Q9CPR7 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sike1Q9CPR7 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sike1Q9CPR7 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sike1Q9CPR7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sike1Q9CPR7 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sike1Q9CPR7 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms