Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
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