Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Gm15937-201ENSMUST00000120727 1235 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms