Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms