Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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TrabdQ99JY4 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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TrabdQ99JY4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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TrabdQ99JY4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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TrabdQ99JY4 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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