Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Lims1Q99JW4 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lims1Q99JW4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms