Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms