Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Plec-208ENSMUST00000080857 14959 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 Ccdc47-201ENSMUST00000002043 5193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 Naca-202ENSMUST00000092048 6745 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 Itsn1-208ENSMUST00000114002 14012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Ift172-201ENSMUST00000041565 5403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Adamts13-202ENSMUST00000102891 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Brpf1-201ENSMUST00000113117 4540 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Tenm4-201ENSMUST00000107162 11021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms