Protein–RNA interactions for Protein: Q924L1

Letmd1, LETM1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letmd1Q924L1 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Letmd1Q924L1 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms