Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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