Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
GcaQ8VC88 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms