Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Impg1Q8R1W8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms