Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Hoxc12Q8K5B8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Hoxc12Q8K5B8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Hoxc12Q8K5B8 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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