Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hecw1Q8K4P8 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms