Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Prpf39Q8K2Z2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Prpf39Q8K2Z2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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