Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
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Ercc8Q8CFD5 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Ercc8Q8CFD5 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Ercc8Q8CFD5 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Ercc8Q8CFD5 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Ercc8Q8CFD5 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Ercc8Q8CFD5 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Ercc8Q8CFD5 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Ercc8Q8CFD5 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Ercc8Q8CFD5 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Ercc8Q8CFD5 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Ercc8Q8CFD5 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Ercc8Q8CFD5 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Ercc8Q8CFD5 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Ercc8Q8CFD5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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