Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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