Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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