Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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Nhsl1Q8CAF4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhsl1Q8CAF4 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhsl1Q8CAF4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhsl1Q8CAF4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Nhsl1Q8CAF4 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Nhsl1Q8CAF4 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Nhsl1Q8CAF4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhsl1Q8CAF4 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhsl1Q8CAF4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhsl1Q8CAF4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Nhsl1Q8CAF4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhsl1Q8CAF4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhsl1Q8CAF4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhsl1Q8CAF4 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Nhsl1Q8CAF4 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhsl1Q8CAF4 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhsl1Q8CAF4 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhsl1Q8CAF4 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhsl1Q8CAF4 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Nhsl1Q8CAF4 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhsl1Q8CAF4 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Nhsl1Q8CAF4 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Nhsl1Q8CAF4 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Nhsl1Q8CAF4 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Nhsl1Q8CAF4 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Nhsl1Q8CAF4 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Nhsl1Q8CAF4 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Nhsl1Q8CAF4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Nhsl1Q8CAF4 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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