Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spef2Q8C9J3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spef2Q8C9J3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spef2Q8C9J3 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spef2Q8C9J3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spef2Q8C9J3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spef2Q8C9J3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms