Protein–RNA interactions for Protein: Q8C165

Pm20d1, N-fatty-acyl-amino acid synthase/hydrolase PM20D1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d1Q8C165 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pm20d1Q8C165 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pm20d1Q8C165 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pm20d1Q8C165 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pm20d1Q8C165 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pm20d1Q8C165 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pm20d1Q8C165 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pm20d1Q8C165 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pm20d1Q8C165 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pm20d1Q8C165 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pm20d1Q8C165 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pm20d1Q8C165 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pm20d1Q8C165 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pm20d1Q8C165 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pm20d1Q8C165 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms