Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
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Ctdsp2Q8BX07 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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