Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc5dQ8BV57 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms