Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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Pggt1bQ8BUY9 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Pggt1bQ8BUY9 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Pggt1bQ8BUY9 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Pggt1bQ8BUY9 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Pggt1bQ8BUY9 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Pggt1bQ8BUY9 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Pggt1bQ8BUY9 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Pggt1bQ8BUY9 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Pggt1bQ8BUY9 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Pggt1bQ8BUY9 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Pggt1bQ8BUY9 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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