Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nop53Q8BK35 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nop53Q8BK35 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nop53Q8BK35 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nop53Q8BK35 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nop53Q8BK35 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nop53Q8BK35 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nop53Q8BK35 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nop53Q8BK35 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nop53Q8BK35 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nop53Q8BK35 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nop53Q8BK35 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nop53Q8BK35 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nop53Q8BK35 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nop53Q8BK35 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nop53Q8BK35 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms