Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms