Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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