Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Amigo1Q80ZD8 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Amigo1Q80ZD8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Amigo1Q80ZD8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Amigo1Q80ZD8 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Amigo1Q80ZD8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
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Amigo1Q80ZD8 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Amigo1Q80ZD8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Amigo1Q80ZD8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Amigo1Q80ZD8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Amigo1Q80ZD8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Amigo1Q80ZD8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Amigo1Q80ZD8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Amigo1Q80ZD8 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Amigo1Q80ZD8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Amigo1Q80ZD8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Amigo1Q80ZD8 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Amigo1Q80ZD8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Amigo1Q80ZD8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Amigo1Q80ZD8 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Amigo1Q80ZD8 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Amigo1Q80ZD8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Amigo1Q80ZD8 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Amigo1Q80ZD8 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
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