Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrfn4Q80XU8 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms