Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Ttc28Q80XJ3 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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Ttc28Q80XJ3 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Ttc28Q80XJ3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Ttc28Q80XJ3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Ttc28Q80XJ3 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Ttc28Q80XJ3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Ttc28Q80XJ3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms