Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
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